當在控制不佳的實驗室或現場條件下處理聚合物時，溶液的穩定性變得更加復雜。由于溶液可能在高溫下暴露數周或數月，粘度損失嚴重。特別是對于高分子量聚合物，在高速攪拌和超聲波作用等高剪切應力作用下，其分子量和粘度會降低。

與其他水溶性聚合物化合物一樣，聚丙烯酰胺水溶液的穩定性隨著老化幾天或幾周而降低。人們提出了許多原因來解釋與初始鏈斷裂無關的粘度損失，其中最合理的解釋似乎是粘度的降低是由鏈構象的變化引起的流體機械體積的逐漸減小引起的。新溶解的聚合物含有硬塊，硬塊是由分子內氫鍵環和螺旋結構組成的剛性鏈段，是穩定的。

然而，由于熵的作用，氫鍵慢慢離解并重新形成，使大分子更光滑，線圈更小，流體的機械體積和粘度更小。這將降低其有效性。均聚物在制造、儲存和運輸過程中受到仔細控制，并放置在50℃或更低的溫度下，不會顯著損失分子量或降低粘度。

目前，沒有足夠的證據來確定聚丙烯酰胺水溶液的穩定性是否受到微生物在溶液中消耗PAM的影響。然而，微生物經常在溶液中生長，特別是當溶液被污染時，它會從最初的透明變為渾濁，甚至沉淀。當分子量超過1.5 X 106時，在75℃或更高的老化溫度下，粘度損失和分子量下降將同時發生。